Ze względu na zachwianie równowagi ekologicznej w ekosystemach leśnych przez człowieka stan lasu musi być ciągle kontrolowany. Aby utrzymać drzewostany w dobrej kondycji zdrowotnej oraz zachować ich zróżnicowanie i wielofunkcyjność, nieuniknione są pewne działania zmierzające do regulacji oddziaływania różnych elementów składowych biocenoz. Ze względu na centralną rolę drzew w lasach działania te koncentrują się na:

- monitorowaniu i ewentualnym ograniczaniu czynników biologicznych uszkadzających różne części drzew;

- poprawie warunków życia sprzymierzeńców drzew, głównie z gromady ptaków.

Duża zasobność siedlisk i urozmaicony skład gatunkowy sprawia, że poważniejsze szkody występują głównie w drzewostanach świerkowych, które zwykle nie są dostosowane do miejscowych warunków wzrostu i rozwoju drzew.

Poniższy wykres przedstawia ilość tzw. posuszu (uschniętych drzew) świerkowego pozyskanego w ramach pozaplanowych cięć w latach 1987-2008.

 Jak widać w roku 2007 rozpoczął się drugi w ciągu ostatnich dwudziestu lat okres masowego występowania kornika drukarza (pierwsze takie zjawisko gradacyjne wystąpiło w latach 1993-96).

Obok zamierania świerczyn poważnym problemem są uszkodzenia powodowane przez zwierzynę (jeleń, daniel, sarna), co wynika w dużej mierze z rozciągnięcia strefy ekotonowej w efekcie rozdrobnienia lasów. Mimo pełnionego nadzoru nad gospodarką łowiecką w obwodach znajdujących się w granicach jednostki, nadleśnictwo ma bardzo ograniczony wpływ na zagęszczenie jeleniowatych, m. in. przez sąsiedztwo z Republiką Czeską. Większość uszkodzeń powodowanych przez zwierzynę należy jednak do tzw. szkód gospodarczo znośnych, a większe problemy występują tylko lokalnie.

Do głównych zadań w dziale ochrony lasu realizowanych w nadleśnictwie należą:

- monitoring liczebności kornika drukarza i rytownika pospolitego;

- usuwanie drzew zasiedlonych przez zespół kornika drukarza;

- ochrona upraw leśnych przed zwierzyną;

W celu ochrony pożytecznej fauny realizuje się;

- wywieszanie budek lęgowych;

- dokarmianie ptaków;

- zabezpieczanie mrowisk